Anti - herpes 111

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riposizionamento computazionale della medicina etno chiarita complesso GB-GH-gL come nuovi agenti anti herpes altro obiettivo astratto virus Herpes sfondo sono importanti patogeni umani che possono causare lievi a infezioni gravi per tutta la vita con alta morbilità. Rimangono latente nelle cellule ospiti e possono causare infezioni ricorrenti che potrebbero rivelarsi fatali. Questi virus sono noti per infettare le cellule ospiti provocando la fusione di proteine ​​di membrana delle cellule virali e di accoglienza. Fusion è realizzato con l'ausilio di componenti di macchine a fusione conservati, glicoproteine ​​gB, complesso eterodimero gH-gL insieme ad altri componenti non-conservato. Considerando, un'altra glicoproteina gD importante senza il quale l'ingresso del virus per la cella non è possibile, agisce come un co-attivatore per la formazione del complesso gB-gH-gL. Così, questa interfaccia formazione del complesso è il bersaglio farmaco più promettente per lo sviluppo di nuovi farmaci candidati anti-herpes. Nel presente studio, proponiamo un modello per il legame di GH-GL per gB glicoproteina che conduce dal pre di inviare i cambiamenti conformazionali durante la formazione complessa GB-GH-GL e riportato i residui chiave coinvolte in questa attività di legame con possibili posizioni vincolanti del sito. Per convalidare l'targetability droga del nostro sito di legame proposto, abbiamo riposizionato alcune delle più promettenti in vitro. in vivo validato molecole anti-herpes al sito di legame proposto del complesso gH-GL in un approccio computazionale. Metodi Hex software 6.3 standalone è stato utilizzato per l'attracco studi proteina-proteina. ArgusLab 4.0.1 e Accelrys Discovery Studio 3.1 Visualizer software sono stati utilizzati per gli studi di docking semi-flessibili e la visualizzazione delle interazioni, rispettivamente. recettori di proteine ​​e composti etno sono stati recuperati dalla Protein Data Bank (PDB) e le banche dati PubChem rispettivamente. Lipinskis Filter, server online Osiris proprietà Explorer e Lazar sono stati usati per controllare la fedeltà farmaceutica dei farmaci candidati. Risultati Attraverso di docking studi proteina-proteina, è stato identificato che i residui di amminoacidi VAL342, GLU347, SER349, TYR355, SER388, ASN395, HIS398 e ALA387 di GH-GL complesso gioco un ruolo attivo nella sua attività di legame con GB. Semi aggancio analisi flessibile più promettenti in vitro. in vivo validato anti-herpes molecole di targeting i suddetti residui chiave menzionati di complesso gH-GL ha dimostrato che tutti i composti medicinali etno analizzati hanno attraccato con successo nel sito di legame proposto di GH-GL glicoproteina con legame intervallo di energia tra i -10.4 a -6.4 K CAL. / mol. Conclusioni riposizionamento di successo dei composti analizzati al sito di legame proposto conferma la targetability farmaco di complesso GH-Gl. Sulla base della energia di legame libera e proprietà farmacologiche, proponiamo (3-cloro fenil) metil-3,4,5 trihydroxybenzoate come merita una piccola molecola di etno piombo medicinale per un ulteriore sviluppo come potente anti-herpes farmaco candidato mira GB-GH-gL interfaccia formazione del complesso. Parole Herpes simplex virus GB-GH-gL complesso Etnomedicina aggancio (3-cloro fenil) metil-3, 4, 5 trihydroxybenzoate Sfondo Quasi 85 della popolazione mondiale è infettato da virus herpes simplex di tipo 1 e di tipo 2 (HSV-1 e HSV -2), che sono due membri della famiglia Herpesviridae 1. HSV infetta tessuti epiteliali in primo luogo e poi si diffonde al sistema nervoso periferico, dove la latenza stabilisce nei neuroni. Recurrent HSV-1 e HSV-2 infezioni in genere causano lesioni orali e genitali rispettivamente 2. infezioni da HSV sono più spesso nelle persone con sistema immunitario soppresso, come quelli affetti da AIDS rispetto ad altri 3. Questi virus sono noti per infettare le cellule ospiti provocando la fusione di proteine ​​di membrana delle cellule virali e di accoglienza. Fusion è realizzato con l'aiuto di componenti di macchine di fusione conservate che consiste di glicoproteine ​​gB complesso, eterodimero gH-gL insieme ad altri componenti non conservati. La formazione del complesso GB-GH-GL è fondamentale per l'herpes l'ingresso del virus nella cellula ospite, rendendo questa interfaccia l'obiettivo farmaco più promettente. Durante il processo di questa formazione complessa, GB è stato proposto di sottoporsi drammatici riarrangiamenti conformazionali (in modo ombrello) come indicato in figura 1 e legame diretto di GH-GL è stato pensato per essere l'innesco per questo riarrangiamenti conformazionali. Completa le caratteristiche strutturali di glicoproteine ​​gB e GH-GL insieme con la loro proposta di modalità di azioni può essere trovato altrove in dettaglio 4. 5. Considerando, un'altra glicoproteina gD importante, senza il quale l'ingresso del virus per la cella non è possibile, agisce come un co-attivatore per la formazione del complesso gB-gH-gL 6. 7. rappresentazione pittorica del modello proposto da Heldwein, EE et. al, 4 per il pre per pubblicare fusione cambiamenti conformazionali in GB. Ruolo di Etnomedicina nella ricerca di nuovi farmaci antiherpes L'aciclovir analogo nucleosidico, un diffuso farmaco anti-herpes, non è in grado di curare le infezioni croniche e recidive. L'uso di questo farmaco spesso porta allo sviluppo di resistenza virale accoppiato ad effetti collaterali e la latenza virale 8. Quindi la scoperta di nuovi farmaci antiherpes con elevata specificità per inibire l'infezione virale merita un grande sforzo. D'altra parte, una vasta gamma di composti antimicrobici con attività antivirale è descritta nella letteratura medica tradizionale. La medicina tradizionale gode nuovo interesse trovato tra microbiologi a causa della crescente resistenza agli antibiotici e limitata durata della vita degli antimicrobici convenzionali. Si tratta di una pratica comune in vari campi della biomedicina per scegliere le piante descritte nella medicina tradizionale per la ricerca di nuovi agenti terapeutici di successo 9. La maggior parte dei composti medicinali etnico sono stati ignorati dai medici nonostante la loro provata in vitro e in vivo proprietà antivirali per mancanza di prove sulla loro modalità di azione, dosaggio efficace, composizione chimica e la tossicità 10. Recenti studi hanno riportato promettenti attività virali anti-herpes di diversi estratti di piante, alcune delle costituenti attivi di questa estratti vegetali sono segnalati per avere un potenziale di interferire con l'RNA e la sintesi proteica, la replicazione del DNA, la fusione cellulare, l'attaccamento e la penetrazione, l'ingresso di virus e di destinazione legame cellulare, mentre alcuni sono interferire in più di una fase del ciclo di vita del virus dell'herpes, con conseguente meccanismi d'azione complementari ai farmaci antivirali esistenti, come rivisto altrove in letteratura 11. In questo scenario, il presente lavoro è un tentativo di chiarire il possibile meccanismo di azione di vari promettenti in vitro. in vivo herpes anti-convalidati Ethno composti medicinali per inibire il meccanismo di fusione virale attenuando l'interfaccia di formazione del complesso GB-GH-gL in un approccio computazionale. Metodi di preparazione proteina recettore Le strutture cristalline di glicoproteina B (GB) (PDB ID: 2GUM) 4 e GH-GL complesso (PDB ID: 3M1C) 5 del virus Herpes simplex, che sono stati risolti con il metodo di diffrazione dei raggi X con una risoluzione fattore di, rispettivamente, 2,10 e 3,00 sono stati ottenuti da Protein Data Bank (PDB) 12. Metodologia adattata per la preparazione di proteina recettore complesso gH-gL per gli studi di docking flessibile semi stato descritto altrove in dettaglio 13. La struttura modificata così ottenuto è stato salvato in formato PDB e utilizzata per tutti gli studi di docking. La selezione e la preparazione di leganti strutture dei composti medicinali etno con provata in vitro e in vivo contro l'herpes come rivisto altrove in letteratura 11 sono stati recuperati dal database PubChem 14. Tutti i composti recuperati sono stati sottoposti a screening con i vincoli ADME secondo la regola Lipinskis. Infine, 29 composti sono stati selezionati per ulteriori studi, che erano in conformità con la regola Lipinskis. Preparazione dei ligandi selezionati è stata effettuata utilizzando il software 4.0.1 ArgusLab 15, aggiunta di perdere atomi di idrogeno e la fedeltà di tutte le obbligazioni è stata controllata utilizzando aggiungere rispettivamente idrogeno e le opzioni di ibridazione Clean. Ottimizzazione della geometria è stato fatto utilizzando Meccanica UFF molecolare (MM) Metodo 16 20. Infine, tutti i composti sono stati salvati in. mol ​​formato per ulteriori studi di docking. Docking proteina-proteina di docking proteina-proteina è stata effettuata utilizzando Hex 6.3 software 21 tra il dominio II di glicoproteina gB (recettore) e H2 Dominio di GH-GL complesso eterodimero (ligando). Su 2000 possibili soluzioni, la migliore modalità binding soluzione viene selezionato per identificare i residui chiave coinvolti nella loro attività di legame. Seguenti parametri sono utilizzati nei controlli attracco di Hex 6.3 per ottenere i migliori risultati: Correlazione tipo-forma solo FFT modalità-3D Post-elaborazione-MM minimizzazione Dimensione modulare-0,4 Solutions-2000 gamma-180 Receptor passo size-7.5 Ligand gamma-180 Passo size-7.5 Twist gamma-360 Passo size-5.5 Distanza gamma-40 Scan step-0,8-sottofasi 0 sterici scan-18 finale di ricerca-25, mentre i parametri utilizzati per il clustering controlli per ottenere i migliori risultati sono i seguenti: Max Clusters - 500 soluzioni Ordina per-cluster di visualizzazione cluster-Best cluster finestra-200 RMS soglia-3.0 Bumps soglia-0. Semi-flessibile di aggancio di aggancio tra il recettore del GH-GL proteine ​​e ligando è stata effettuata utilizzando Dock un'opzione Ligand di software ArgusLab 4.0.1. Una spaziatura di 0,4 tra i punti della griglia è stata utilizzata. ArgusDock è stato selezionato come attracco del motore. Ricerca è stata eseguita attivando l'opzione di precisione in menù docking precisione, bacino è stato scelto come tipo di calcolo, flessibile per il ligando e Ascore è stato utilizzato come funzione di punteggio. sono stati consentito un massimo di 150 pose da analizzare, scatola sito di legame è stato fissato a 25 25 25 Angstrom fino a comprendere l'intero sito attivo, e ogni attracco corsa è stato ripetuto tre volte per ottenere i migliori risultati. Analisi e la visualizzazione dei risultati della simulazione di docking La docking risultati di ArgusLab 4.0.1 sono stati salvati in formato PDB. Fuori dei risultati di 150 modelli, uno con i dati di legame meno energia libera è stato selezionato. Analisi, la visualizzazione delle interazioni e rendering di tutte le immagini di docking è stato fatto utilizzando Accelrys Discovery Studio 3.1 software Visualizer 22. proprietà farmacologiche dei composti descrittori molecolari, come log P, il numero di donatori legame idrogeno, il numero di accettori legame idrogeno, e la massa molecolare dei composti sono stati analizzati utilizzando Lipinski filtro. Osiris Proprietà Explorer e Lazar sono stati utilizzati per analizzare vari attributi dei farmaci, come ad esempio la tossicità e il punteggio di droga. Risultati e discussione identificazione del sito attivo e validazione Chowdary TK et. al proposto un sito di legame gB nel dominio H2 del complesso gH-GL per la formazione del complesso GB-GH-gL attraverso il legame diretto che è il passo fondamentale nella formazione di fusogen, successivamente che porta alla ingresso del virus nelle cellule ospiti 5. Doina Atanasiu et. al, postulato che Dominio II di GB contiene i residui che sono direttamente coinvolti in GB legame con gH-GL 23. Sulla base dei postulati di cui sopra e tenendo in considerazione le proposte ombrello stile drammatici riarrangiamenti conformazionali in GB glicoproteina, che è stato pensato per essere innescato da legame diretto di GH-GL, autore principale di questo manoscritto Syed Hussain Basha ha ipotizzato un modello di pre per inviare cambiamenti conformazionali durante la formazione del complesso gB-gH-gL come mostrato in Figura 2. ed eseguito un aggancio proteina-proteina tra studio dominio II di gB e H2 dominio del complesso gH-gL utilizzando software Hex 6.3 per identificare i residui amminoacidici chiave coinvolti nel contatto iniziale tra le due glicoproteine ​​che portano alla loro formazione complessa, e visualizzati che VAL 342, GLU 347, SER 349, TYR 355, SER 388, ASN 395, la sua 398 e ALA 387 residui di aminoacidi del complesso gH-gL formando idrogeno obbligazioni con LYS 435, ARG 418, GLN 438, PRO 439, LEU 399, GLU 401 e 437 GLY di gB glicoproteina (Figura 3). I siti di legame proposto di GB e GH-GL glicoproteine ​​è stato mostrato in Figura 4. Per il presente studio, proposto sito di legame di GH-GL (Figura 4 B), con residui di aminoacidi VAL 342, GLU 347, SER 349, 355 TYR , SER 388, ASN 395, HIS 398 e ALA 387 è stata definita come il sito di legame per gli studi di docking. Per convalidare l'targetability farmaco della nostra proposta di sito di legame attivo nella gH-GL, abbiamo riposizionato alcune delle più promettenti in vitro. in vivo validato molecole anti-herpes al sito di legame proposto del complesso gH-GL in un approccio attracco simulazione computazionale. Tuttavia, un'ulteriore conferma del proposto sito di legame del GH-GL tanto bersaglio promettente farmaco per proposto sito di legame in GB è stata dedotta altrove in dettaglio 24. modello proposto per il legame di GH-GL (verde) per GB (giallo) glicoproteina. Lato sinistro del quadro raffigura la vista dall'alto di eventi che hanno portato da pre di inviare i cambiamenti conformazionali durante la formazione complessa GB-gH-GL, mentre il lato destro del quadro raffigura la vista frontale. Piccole frecce di colore rosso indicano le zone proposte contatto iniziale tra le due glicoproteine. La visualizzazione dei residui chiave coinvolti nella formazione del complesso GB-GH-Gl. A) i residui di aminoacidi coinvolti nella formazione del complesso GB-GH-gL, Blu residui di aminoacidi VAL 342, GLU 347, SER 349, TYR 355, SER 388, ASN 395 colorati, HIS 398 e ALA 387 appartengono al complesso gH-GL , considerando che i residui di colore giallo di aminoacidi colorati LYS 435, ARG 418, GLN 438, PRO 439, LEU 399, GLU 401 e GLY 437 appartengono a gB glicoproteina. B) modello ipotizzato per primo legame del complesso gH-GL per GB al loro dominio H2 e Dominio II, rispettivamente. Visualizzazione delle glicoproteine ​​gB e complessi gH-GL: A) sito di legame (verde proposto) per il dominio H2 del complesso gH-gL in GB (per una migliore sito di legame chiarezza è mostrata in stato post conformazione GB) B) proposto sito di legame ( giallo) per il settore II di GB nel complesso GH-gl. L'interazione dei composti etno con il sito attivo l'attracco risultati in PPB sono stati visualizzati con Accelrys Discovery Studio 3.1 software Visualizer. Un totale di 150 pose sono stati visualizzati per ciascuno dei 29 composti medicinali etno per identificare il modello con migliori valori di aggancio, basato sulle interazioni energia di legame. Il risultato di aggancio mostrato che tutti i 29 composti analizzati legami idrogeno forma con vari residui di aminoacidi nella molecola bersaglio, nell'intervallo di 08 legami idrogeno (Tabella 1). Oltre ai legami di idrogeno, diverse altre interazioni come pi-cationico, interazioni pi-pi e altri legami non covalenti hanno pensato di svolgere un ruolo fondamentale nella stabilizzazione dei composti ormeggiata nel sito di legame proposto del complesso GH-Gl. In tutti i composti analizzati, O atomo su C O e OH gruppi funzionali sono stati osservati a svolgere un ruolo chiave nella formazione legami idrogeno. Le figure 5 e 6 illustra le interazioni dei 6 migliori composti analizzati verso il sito abbuffate di destinazione del complesso gH-GL che mostrava buone proprietà farmacologiche senza tossicità. Il legame risultato di docking simulazione energia libera di composti etno verso complesso gH-gL di HSV e il numero di legami idrogeno si formano insieme i residui di aminoacidi coinvolti nelle interazioni NALP pose di ligando accettabili. I risultati di simulazioni di docking. Le interazioni tra: A) Yatein e residuo di amminoacido ARG 318 di GH-GL complesso B) residui methylgallate e aminoacidi GLY 270, THR 251 e HIS 398 di GH-GL complesso C) Epiafzelechin e aminoacidi residui GLY 268 e VAL 394 di GH-gL complesso D) Oxyresveratrol e aminoacidi residui THR 251 di GH-gL complesso e) Cochinolide e aminoacidi residui TYR319, ARG318 e ASN395 di GH-gL complesso F) catechina con i residui di aminoacidi GLY270, ARG318 e THR350 di GH complesso - GL. Binding energia libera (rilegatura G) Secondo i risultati di docking (Tabella 1), tutti i 29 composti testati ancorata nel sito attivo della molecola proteina bersaglio con successo, con una energia di legame compresa tra -10.4 a -6.4 K. cal./ mol. Di tutti i composti analizzati, (3-cloro fenil) metil-3,4,5 trihydroxybenzoate mostrava meno energia di legame possibile -10,4 K. cal./mol formando 4 legami idrogeno con residui amminoacidici ASP 187, ARG 318 , TYR 319 e ASN 395 (Figura 7). Considerando che, isoborneolo e linalolo ha mostrato il più alto possibile energia di legame privo di -6.4 K. cal./mol. rispettivamente -7.3 K. cal./mol, senza formazione di legami idrogeno con qualsiasi residui amminoacidici sito attivo. L'acido caffeilchinici formò i più alti possibili legami idrogeno (8 obbligazioni) con THR 251, ARG 318, 319 TYR, ASN 395 e la sua 398 residui di aminoacidi della proteina recettore bersaglio con una energia di legame di -8.9 K. cal./mol. Mentre Lignan era in grado di attraccare nel sito di legame proposto. Docking risultato della simulazione di Best legante. A) Il legame di (3-cloro fenil) metil-3, 4, 5 trihydroxybenzoate nel sito di legame proposto complesso gH-gL. B) residui di aminoacidi Arg 318, TYR 319, ASP 187 e 395 ASN, che sono coinvolti nel legame del composto nel sito di legame proposto del complesso gH-gL formando legami idrogeno (rosse linee tratteggiate) con -10.4 K. cal./mol di energia di legame. I valori argusdock di G legame riportati nella tabella 1 mostra che ogni ligando ha G negativo, il che dimostra che tutti i composti medicinali etno analizzate per il legame con il complesso gH-gL sono altamente stabili. Queste energie libere di legame negative anche evidenziato che la reazione è spontanea. Pronostico proprietà farmacologiche Lipinski filtro e Osiride proprietà Explorer sono stati utilizzati per lo screening del candidato farmaco basato sulla Lipinskis Rule of Five e biodisponibilità orale. Gli attributi farmacologico risultati di previsione vengono visualizzati in (sui file 1. Tabella S1) e le strutture di tutti i composti medicinali etno utilizzati per lo studio sono illustrati nella aggiuntive file 1. Figura S1. Sulla base dei valori sperimentali, è stato dedotto che tutti i composti medicinali etnico soddisfatto con successo tutti i parametri di Lipinskis Regola Cinque con l'eccezione del donatore di idrogeno per l'acido caffeilchinici. I parametri della regola Lipinskis sono i seguenti: il peso molecolare deve essere di 10, e la gamma rifrangenza molare deve essere compresa tra 40130. Come per la regola vebers, biodisponibilità orale dei farmaci potrebbe essere misurata dal peso molecolare, numero di legami girevoli ( n ROTB), il numero di legami idrogeno, e la distesa della superficie polare farmaci (TPSA). La biodisponibilità orale è stato caratterizzato da piccolo peso molecolare (inferiore a 500 Da) Inoltre, il numero di legame ruotabile deve essere inferiore a 10, il numero di donatori legame idrogeno e accettori deve essere inferiore a 12, e TPSA valori inferiori a 140. Ulteriori file 1. Tabella S1 mostra che tutti i composti hanno una buona bioavaibility orale, con esclusione dell'acido caffeilchinici e acido rosmarinico. La idrofobicità dei farmaci potrebbe essere dedotto dal valore di log P. Log P valori sono direttamente proporzionali alla idrofobicità orale del farmaco. Più idrofoba, il farmaco è, maggiore è la capacità del farmaco a circolare più nel nostro corpo. Si wouldnt essere facile espellere un tale farmaco. Nel presente studio, sono stati osservati i valori Log P delle molecole farmaceutiche per essere nella gamma di -0.4 a 6. stata osservata La massima Log valore P di 6 per Bisbenzylisoquinoline, seguita da 3.8 per Lignan e Yatein, che dimostra che Bis - benzylisoquinoline era la molecola più idrofoba tra tutti i analizzato. Tuttavia, antrachinone, galangina, isoborneolo, Lignan, linalolo, (3-cloro fenil) metil-3,4,5 trihydroxybenzoate, Oxyresveratrol, Physcion, resveratrolo, Rhein, acido rosmarinico, Wogonin e Yatein ha anche mostrato una buona idrofobicità con una gamma di registro P tra 25. il valore di punteggio farmaco è un tale valore pratico utile che è una combinazione di variabili quali somiglianza farmaco, Log P, solubilità, peso molecolare e rischio di tossicità, che potrebbero essere utilizzati per la valutazione di un potenziale farmaco candidato. Una molecola farmaco con un punteggio migliore farmaco ha una maggiore possibilità di essere un candidato di droga. Come per i valori mostrati in Tabella 1. Ulteriori file di S1, catechina con un farmaco punteggio 0,87 mostrato la più alta possibilità di essere un potenziale farmaco e Zeatin con un punteggio farmaco di 0,1 dimostrato di essere il meno droga potenziale possibile. Predizione di tossicità Osiris proprietà Explorer e Lazar stati usati per prevedere la tossicità dei composti nel presente studio. Le previsioni erano basate sulla somiglianza gruppo funzionale per la molecola query con in vitro e in vivo composti convalidato presenti nel database di questi due programmi online. risultati Osiride Proprietà Explorer sono stati visualizzati con codici colore. Il risultato di analisi della tossicità di tutti i composti analizzati etno è mostrata in Ulteriori file 1. Tabella S2. il colore verde indica bassa tendenza tossico, spettacoli giallo il midcore e il colore rosso indica elevata tendenza di tossicità. file aggiuntivo 1. Tabella S2 mostra che Antrachinone, apigenina, caffeico acido, galangina, Kaempferol, linalolo, Morin, Floroglucinolo, quercetina, resveratrolo, Zeatin hanno elevata tossicità. Mentre allicina, Bis-benzilisochinolina, acido caffeilchinici, catechina, Cochinolide, Epiafzelechin, isoborneolo, Lignan, (3-cloro fenil) metil-3,4,5 trihydroxybenzoate, Methylgallate, Oxyresveratrol, Rhein, acido rosmarinico, Wogonin e Yatein non aveva tossico effetto, mentre altri composti avevano tossicità midcore. Lazar è un pacchetto software che viene utilizzato per rilevare le proprietà mutagene e / o cancerogeni sulla base delle analogie gruppo funzionale con quelli mutageni e / o cancerogeni presenti nel suo database. file aggiuntivo 1. La tabella S3 mostra i risultati delle analisi della tossicità di composti di Lazar. Il set di dati di formazione di molecole presenti nel programma sono stati verificati Lazar effettuando un test con Salmonella typhimurium. file aggiuntivo 1. Tabella S3 dimostra che l'Aloe-emdoin, antrachinone, Baicalein, Bisbenzylisoquinoline, galangina, Morin, Physcion, quercetina, Rhein, Wogonin e Zeatin hanno proprietà mutagene. Mentre l'acido caffeico, acido caffeilchinici, catechina, Cochinolide, Epiafzelechin, Lignan, linalolo, (3-cloro fenil) metil-3,4,5 trihydroxybenzoate, Methylgallate, Oxyresveratrol, Floroglucinolo, il resveratrolo, l'acido rosmarinico e Yatein non hanno proprietà mutagene. Inoltre, la cancerogenicità dei composti è stata verificata in studi sperimentazione animale silico con il mouse. file aggiuntive 1. Tabella S3 mostra che tutti i composti analizzati hanno cancerogenicità, con l'eccezione di Zeatin. Screening per il miglior composto a base di attracco e probabilità di droga risultati Si è accertato che (3-cloro fenil) metil-3,4,5 trihydroxybenzoate è stato il migliore herpes anti-virale composto medicinale etno sulla base della sua G vincolante rispetto ad altri composti seguita da bis-benzilisochinolina e acido rosmarinico con una energia di legame di circa -10 K. cal/mol. Tuttavia, Bis-benzilisochinolina e acido rosmarinico hanno cattive caratteristiche farmacologiche e di tossicità, in base alle proprietà farmacologiche. L'acido rosmarinico ha un valore TPSA di più al di sopra del parametro soglia Vebers regola, mentre Bisbenzylisoquinoline ha mostrato una notevole mutagenicità. (3-cloro fenil) metil-3,4,5 trihydroxybenzoate ha mostrato buoni attributi farmacologiche, dal momento che soddisfatto il Lipinskis Regola, Vebers Regola, Log P valori, la tossicità e la soglia di punteggio di droga. Tuttavia, in base alle proprietà farmacologiche, acido caffeilchinici, la catechina, Cochinolide, Epiafzelechin, Lignan, (3-cloro fenil) metil-3,4,5 trihydroxybenzoate, Methylgallate, Oxyresveratrol, acido rosmarinico e Yatein ha mostrato buoni attributi farmacologici. Questi composti sono stati trovati a rispettare regola Lipinskis, regola Vebers e parametri di biodisponibilità orale, con l'eccezione di acido caffeilchinici e acido rosmarinico, a causa del loro valore TPSA hanno superato la soglia di 140. Conclusione L'analisi ha mostrato che l'energia di legame (3-cloro fenil) metil-3,4,5 trihydroxybenzoate aveva un valore minimo di energia di legame di -10.4 K. cal/mol rispetto ad altri composti seguita da acido rosmarinico Bisbenzylisoquinoline e con il legame valori di energia di -10.1 K. cal/mol ciascuna, tra tutti i composti analizzato. Visualizzazione delle interazioni mostrato che O atomo su C O e gruppi - OH di tutti i composti esaminati giocato un ruolo importante nella formazione di legami idrogeno con residui amminoacidici della molecola recettore. In conclusione, i nostri risultati suggeriscono fortemente che (3-cloro fenil) metil-3, 4, 5 trihydroxybenzoate vale un composto etnico piombo per sviluppare ulteriormente come un potente inibitore contro virus Herpes simplex di targeting suo complesso proteina di fusione. D'altra parte, successo riposizionamento dei composti analizzati al sito di legame proposto gH-gL far luce sul suo complesso targetability farmaco per ulteriori investigazioni. Tuttavia, poiché questo presente lavoro è solo un passo in avanti verso la comprensione delle intuizioni meccanicistici di un potente inibitore per l'herpes l'ingresso del virus nella cellula ospite mira un'interfaccia complessa GB-GH-gL, ulteriormente in vitro e in vivo convalide sono obbligatori. Le dichiarazioni di conferma SHB appositamente ringraziare e dedicare questo lavoro ai suoi genitori Syed Abdul Khader Basha e Syed Khursheed Begum per fornire le strutture necessarie per svolgere tutto questo lavoro a casa e per il loro costante incoraggiamento e il sostegno, senza il quale questo lavoro di ricerca wouldnt stata possibile . Gli autori desiderano ringraziare il Dr. N. Ramesh, Principal, REVA ISM per il suo tanto aveva bisogno di aiuto. Dr. Atuluri Venu, Principal, Montessori Siva sivani Istituto di Scienza e Tecnologia-College of Pharmacy per estendere il suo aiuto e la motivazione. Dr. Vidyavathi N, Prof. Dipartimento di Biotecnologie, REVA ISM per la lettura della versione precedente di questo manoscritto. Noi riconosciamo con gratitudine Doina Atanasiu e Ashoke Sharon per generosamente donando il loro tempo prezioso nella fornitura di peer review per questo manoscritto. materiale supplementare elettronico 1290620121358MOESM1ESM. docx di file 1 Ulteriori: Tabella S1: I valori descrittori molecolari dei composti etno utilizzati in questo studio insieme ai loro ID di composti PubChem. Tabella S2 tossicità dei composti etno sulla base di previsioni Osiris proprietà Explorer. Tabella S3 tossicità dei composti a base di etno Lazar previsioni del programma figura S1 Strutture dei composti etno utilizzati nel presente studio. (DOCX 499 KB) Autori fascicoli presentati originali per immagini riportano di seguito i link alle iniziale presentata file per le immagini degli autori. Competere interessi Gli autori dichiarano di non avere interessi in gioco. Autori contributi SHB concettualizzato l'idea, effettuate il lavoro compresa l'acquisizione dei dati, l'analisi e l'interpretazione dei risultati finali e stesura del manoscritto. TD assistito SHB nella acquisizione dei dati e RNP ha aiutato con la modifica del manoscritto. Tutti gli autori hanno letto e approvato il manoscritto finale. Autori Affiliazioni ricercatore indipendente, 117-D, WWSC Montessori Siva sivani Istituto di Scienza e Tecnologia-College of Pharmacy Dipartimento di Biotecnologie, REVA Istituto di Scienza e Gestione riferimenti prevenzione e controllo delle malattie virus dell'herpes. Clinica e di laboratorio la diagnosi e la chemioterapia. Volume 63. 1985 Bollettino della OMS, 182-185. Whitley RJ: virus herpes simplex. Campi Virology. A cura di: Knipe DM, Howley PM. 2001 Philadelphia: Lippincott, Williams & Wilkins, 2461-2509. 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